Nació el 2 de Diciembre de 1931 en Nodashi (al noroeste de Tokio). Su primer nombre fue Yoshiaki Hatsumi, pero siendo adulto conoció al gran maestro Takamtsu sensei, este le pidió que se cambiase el nombre de Yoshi -Aki a Masa- Aki ya que decía que el primer kanshi (carácter) era de mala suerte. A la edad de 7 años su padro lo introdujo en Kendo (sendero del sable), luego comenzó a prácticar Judo y también Karate Goju Ryu en el dojo del Gato Yamaguchi, Dojo en el cual más adelante impartiría clases de Karate. Cursando la secundaria fué gimnasta, boxeador y capitán del equipo de futbol. También estudió baile, lo que le ayudo a mejorar el movimiento de piernas en la práctica marcial.

A los 20 años de edad cuando cursaba sus estudios de medicina en la universidad de Meiji, recibió el 4º dan de Judo y le fue solicitado a los soldados americanos, en la base del ejercito en Yokota durante la post guerra. En ese entonces, mientras impartía una clase fue sorprendido por un waza (técnica) similar a oni kudaki (aplastando al demonio), que le hizo dudar. Se pregunto que sentido tenía un sistema de entrenamiento en el cual una persona de mayor tamaño y peso podría sobrepasar los años de entrenamiento y esfuerzo en las artes marciales modernas. El sintió la necesidad de buscar un sistema de lucha que le sirviera para sobrevivir en todas las circustancias.

Decidió entonces dedicarse a buscar una tradición verdadera de artes marciales antiguas. Pagó 300.000 yen por mes durante 3 años a Takashi Ueno, un profesor de Kobudo (artes marciales antiguas), para que le enseñase Bujutsu Juhappan (18 formas de combate de la antiguedad). Al cumplir todo el entrenamiento y aprender al máximo todo el sistema de combate antiguo, Takashi Ueno recomendó a Hatsumi tomar clases con un profesor, por mucho, muy superior a él; y le consiguió una entrevista con Takamatsu Toshitsugu (El Tigre de Mongolia) apodado así por su destreza en combate.

Conoció a Takamatsu Sensei a los 26 años de edad en Kashiwabara. Cuando se conocieron Takamatsu Sensei le entrego un poema que decía:

"En los días de la era Tennei yo era un gran guerrero del koppojutsu, era tranquilo y pacífico como las flores de primavera con mi valentía no temía enfrentar ni a 10.000 enemigos. Podía incluso derribar a un animal salvaje con sólo un soplido ¿Quién en este mundo sería capaz de mantener viva esta voluntad del corazón del guerrero? Y allí estas tú, enviado a mi por los "Dioses Guerreros" he estado esperando por ti, a través de los años."

Hatsumi Sensei viajaba en tren más de 12 horas cada fin de semana quedándose en casa del Gran Maestro para aprender de él, siendo su único discípulo. Hatsumi Sensei cuenta que su entrenamiento con Takamatsu era muy duro. Takamatsu Sensei lo lastimaba mucho, le aplicaba distintos tipos de técnicas al mismo tiempo, era represivo, impredecible. Apreció de Takamtsu Sensei durante 15 años y se convirtió en el único heredero de las 9 tradiciones marciales que hoy conforman la Bujinkan en el año 1968 por mandato de Takamatsu.

En 1972 fallece Takamatsu Sensei. El último ninja por linaje familiar había fallecido. Quedando como único heredero, Hatsumi Sensei, quién amaba a su maestro como a su propio padre. A partir de este año (1972), comienza el proceso de creación de la Bujinkan.

A parte de ser Gran Maestro y Soke (jefo, heredero) de estas trdiciones, el Maestro Hatsumi Sensei posee el título de Dr. en Osteopatía, tutulo PH en Filosofia e Historia de las Artes Marciales. Sirvió como coordinador técnico/historico en distintas series y películas tradicionales de Hapón, también como actor de cine. Es artista plástico y escritor y en la actualidad gracias a su inquebrantable esfuerzo, ha dado a conocer sus disciplinas en todo el mundo, organizando Taikais internacionales y promocionando el Ninjutsu a nivel cultural.